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水生所是从事内陆水体生命过程、生态环境保护与生物资源利用研究的综合性学术研究机构，其前身是1930年1月在南京成立的国立中央研究院自然历史博物馆，1934年7月改名为中央研究院动植物研究所，1944年5月又分建成动物研究所和植物研究所。中国科学院成立以后，于1950年2月将国立中央研究院动物研究所、北平研究院动物学研究所、国立中央研究院植物研究所藻类部门合并，组建中国科学院水生生物研究所，所址上海，1954年9月迁至武汉。2011年水生所整体进入中国科学院“创新2020”试点工程。水生所战略定位和发展目标是，面向国家在水生态环境保护、水生生物资源利用等方面的重大战略需求，围绕内陆水体生命过程、生态环境保护与生物资源利用领域的基础性、战略性和前瞻性重大科技问题，着力重大理论创新和核心技术突破，强化创新价值链的延伸，在水环境保护、淡水渔业和微藻生物技术领域发挥引领示范作用。

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